【アスラン・ザラ】
メンデルの遺伝子研究所で研究・開発されていた人工子宮から生まれた『第２世代の最高のコーディネイター』で、先の戦争の最中にＳＥＥＤ因子を発現させた。
最高のコーディネイト技術を与えたいというパトリック・ザラの意向で、当時コーディネイト技術の権威として知られていたユーレン・ヒビキ博士にコーディネイトされた。本来なら安定した段階で母胎に戻される予定だったが、過度のコーディネイトを施された為かアスランの状態が安定せず、予定時期になっても母胎に戻せる状態にならなかった上、母であるレノア自身も当時農学博士として活躍していたこともあって、パトリックの独断でそのまま人工子宮で育てることを許可された。その為、キラ同様母胎への影響を考慮しない特異なコーディネイトも施された。
ラクスと対の遺伝子を持つとされているが、実際にはキラと対になるように調整されている。
キラが行方不明になって以降、表向きはカガリの私設護衛『アレックス・ディノ』として働いているが、裏では『ザフト軍特務隊隊長アスラン・ザラ』としてオーブや連合の内情を探ったり、クライン派やデュランダル議長と連絡を取りながらキラの行方を捜している。
【キラ・ヤマト】
メンデルの遺伝子研究所で研究・開発されていた人工子宮から生まれた『第１世代の最高のコーディネイター』で、先の戦争の最中にＳＥＥＤ因子を発現させた。
人工子宮の開発者でもあるユーレン・ヒビキ博士の実子だが、双子だったために母であるヴィアを騙したユーレンにより母胎から取り出され、人工子宮及びＳＥＥＤ因子研究の被検体にされた。アスラン同様、多数の特異なコーディネイトを施された。
終戦後アスランと婚約（オーブでは１８にならないとコーディネイターでも結婚は認められないから）し、カガリと双子ということもあって、アスラン共々アスハ家別邸で世間から隠れるように生活していたが、アスランがカガリに呼び出された日に屋敷が何者かに襲撃され、行方不明になる。
現在はブルーコスモスと癒着のあるオーブ氏族の手引きで攫われ、記憶を操作されてファントムペインの一員になっている。愛機はストライクソワレ。
【ラクス・クライン】
evidence-01から発見された因子（ＳＥＥＤ因子）を埋め込まれた最初の成功体。プラントのカリスマとなるべく調整され、より強く人々の心に訴えかける力を特化させている。
受精後しばらくは人工子宮で育てられていたが、後に母胎に戻された為、キラとアスランほど過度に調整は受けていない。
終戦後、アカツキ島のマルキオ導師の導きの家で孤児達の世話をしながら、裏ではクライン派代表として世界情勢を睨みながら水面下に活動している。オーブ議会の面々やカガリにアスランとデュランダル議長の繋がりを悟らせないためのパイプ役も買って出ており、独自の情報網を用いてキラの行方を捜している。
【ギルバート・デュランダル】
かつてヒビキ博士に師事し、ラクス・キラ・アスラン・レイの出生にも関わっていた。
ブルーコスモスによる研究所襲撃を察知したヴィアに生まれたばかりのレイを托された。プラントに渡った後、シーゲル・クラインの保護の元でレイを育てるが、その頃のラクス達との交流で色々思うところがあったらしく、それまでの遺伝子情報至上主義的な思想を転換させ、４人の子供達の人としての幸せを願うようになる。
【レイ・ザ・バレル】
ラウ・ル・クルーゼがテロメアの短さから失敗作のクローンとされた事で、新たにメンデルで生み出されたクルーゼのクローン。
自身の出自も知っているが、育ての親であるデュランダル議長やクライン親子から惜しみなく愛情を注がれて育ったこともあって、議長やラクスに心酔している節がある。
普段はオーブにいるアスランに代わってプラント内部での雑務を請け負うアスランの部下。アスランのプラント帰還に先駆け、ミネルバ配属となる。
【シン・アスカ】
先の大戦の折、オーブで家族を失いプラントへ移住した少年で、オーブの代表氏族（特にアスハ家）を憎んでいる。
不完全ながらもＳＥＥＤ因子を有しており、因子の暴走を危惧したデュランダルによりいずれアスランが率いる予定のミネルバに配属される。
アーモリーワンで偶然であったステラに惹かれる。
【ステラ・ルーシェ】
ファントムペイン所属のエクステンデッドの少女。
アーモリーワンで強奪したガイアの専属パイロットで、その潜在能力の高さからエクステンデッドの中でも過度の調整をされているため、情緒面での安定さを欠く。
過去のトラウマから『死』に過剰反応することから、ブロックワードとして設定されている。
いつも優しく接してくれるキラとネオに懐いており、兄弟同然に育ったスティングとアウルに気を許している。
シンとアーモリーワンで出会ったことは忘れているが、その後ディオキアの街近くで再会して以降、少なからずシンの影響を受けるようになる。
【アウル・ニーダ】
ファントムペイン所属のエクステンデッドの少年。
アーモリーワンで強奪したアビスの専属パイロットで、その潜在能力の高さからエクステンデッドの中でも過度の調整をされているため、普段は性格面で過激さが表立つ。
過去のトラウマから『母』に過剰反応することから、ブロックワードとして設定されている。
キラを姉のように慕っており、兄弟同然に育ったスティングとステラや何かと彼らを気遣ってくれるネオに気を許している。
【スティング・オークレー】
ファントムペイン所属のエクステンデッドの少年。
アーモリーワンで強奪したカオスの専属パイロットで、潜在能力の高さからステラやアウルほどではないがエクステンデッドの中でも過度の調整を施されている。
何かと不安定になりやすいステラとアウルを弟妹のように思っている。
スティング達を当たり前のように一個人として接してくれるキラを姉の用に慕い、彼らを気遣ってくれるネオに気を許している。
【ネオ・ロアノーク】
ファントムペイン所属でアーモリーワン襲撃部隊隊長。キラやステラ達の上官に当たる。
先の大戦の折、瀕死の重症を負ったところをブルーコスモスの部隊に拾われ、記憶操作を受けていたが、キラが部下として配属されてきた際に本来の記憶を取り戻している。
キラやステラ達を助けたいと思っているが、周囲の監視の目が厳しいため思うようにいかない現状に歯噛みしている。
【カガリ・ユラ・アスハ】
オーブ首長連合国の代表首長。ユウナ・ロマ・セイランという婚約者がいるが、本人は先の大戦の折に出会ったアスランに想いを寄せている。
オーブ崩壊の際に義父のウズミからキラとは双子であることを知らされ、それ以降表向きはたった１人の血縁として大切に思っているように振る舞っており、キラとその婚約者であるアスランに何かと便宜を図る。
その反面、内心ではアスランに想われているキラを疎んでおり、キラが行方不明になった一見にも関与していると思われる。
【ファントムペイン】
ブルーコスモスが対コーディネイター用兵士としてあらゆる措置を施して作り上げた強化人間（エクステンデッド）を主力とする特殊部隊。
隊員の中には『コーディネイターを滅ぼすためのコーディネイター』も少数ながら存在する。
エクステンデッド以外の構成員は全てブルーコスモスで、コーディネイター殲滅のためなら手段は選ばない。
【エクステンデッド】
基本的に遺伝子操作以外ならどんな非人道的措置も施されていると見て良いが、本来はゆりかごと呼ばれる調整システム無しに４８時間以上は生活できず徐々に衰弱していく。
例外的にＳＥＥＤ因子所有者の血液から生成された薬を服用し続けることで健常体への治療が可能。
【GAT-X105S ストライクソワレ】
ファントムペインでキラに与えられた専用機。
基本的な性能はX105Eストライクノワールと同じだが、キラ自身の手でＯＳ等の書き換えを行われているため、ザフト製ガンダムの最新鋭機であるカオス・アビス・ガイアにも引けを取らない機体性能を誇る。
フェイズシフト展開時の機体カラーは、ソワレ（夕闇）の名が示すようにディープブルー。
機動性を重視した機体であるため装甲面では他のＭＳに劣るが、キラ独自のカスタマイズによりバリアブルフェイズシフト装甲とラミネート装甲を併用しているため、運用上は問題とされていない。＜一説にはパイロットであるキラがコーディネイターであるため、防御面での考慮がされていないとも言われている。
主たる用途はカオス・アビス・ガイアの３機の支援戦闘だが、連結式ビームライフルや腰部レールガン、伸縮式ビームソードといった遠・中・近距離すべての戦況にあわせた戦闘が可能な兵装を有しており、単機での戦闘も考慮されている。
基本的にエールストライカーの強化版であるシエルストライカーを装備している。
ただし、装甲・兵装共に大幅にエネルギーを消費してしまうため、長時間の稼働は出来ない。
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